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NiCR를 이용한 Pseudomonas alcaligenes의 5S rRNA의 구조 결정
김희정 , 김준태
UCI I410-ECN-0102-2021-500-001304197
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Pseudomonas alcaligenes 의 5S rRNA의 구조를 결정하기 위해 화학적 핵산가수분해효소인 니켈착화합물 (NiCR[(2,12-dimethyl-3,7,11,17-tetraazabicyclo[11,3,1]heptadeca-1, (17),2,11, 13,15-pentaene)nickfil(Ⅱ) perchlorate])을 조제하였다. 이 착화합물이 어느 조건에서 5S rRNA와 잘 반응하여 좋은 결과를 제시하는 지 최적조건을 찾아내고, 절단된 위치가 제안된 이차 및 삼차구조에서 어느 위치인 지를 확인하였다. 5S rRNA가 재원형화 또는 변성되는 과정에서 U49 염기와 C88 염기, G89 염기는 강한 자발적 절단을 나타내며, U89 염기는 약하게 절단됨을 관찰할 수 있었다. 또한 G100 염기는 변성된 조건에서만 절단되며, 이는 각 단계별 반응에서 절단되는 정도가 영향을 받는 것이 관찰되었다. 그러나 재원형화된 시료에서는 이 절단 위치가 나타나지 않았다. 이는 G100 염기가 변성되는 조건에서는 단일 가닥으로 노출되지만 변성되지 .않은 조건에서는 삼차구조에 의하여 착화합물의 접근이 어려운 위치에 자리함을 의미한다.

[자료제공 : 네이버학술정보]
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