비점오염원은 불특정 장소에서 불특정하게 수질오염물질을 배출하는 배출원을 의미하며, 최근 점오염원에 비해 관리가 미흡한 비점오염원에 대한 관심이 증가하고 있다. 환경부에서는 비점오염에 의한 오염부하량을 정량적으로 분석하기 위해 생활계, 축산계, 산업계 등 6개 오염원그룹별 원단위 발생부하량 및 배출부하량을 제공하고 있다. 하지만 비점오염 발생 특성은 지역별 유역특성에 따라 차이가 있어, 유역면적, 토지이용 등에 따라 원단위의 적용성이 다르게 나타날 것으로 예상된다. 따라서 본 연구에서는 원단위에 의한 비점부하량과 수문·수질 모니터링에 의한 부하량을 비교 및 분석하여, 유역특성에 따른 원단위의 적용성을 분석하고자 한다. 대상유역은 청미천 상류유역으로, 축사가 밀집되어 비점오염 발생량에 대한 정확한 분석 및 대책이 필요한 지역이다. 모니터링 지점은 상류에서 하류방향으로 4개 지점을 선정하였고, 유량 및 수질 모니터링을 통해 지점별 오염부하량을 계산하였다. 또한 GIS를 이용하여 모니터링 지점별 집수구역의 유역특성을 분석하였고, 통계자료를 통해 주거, 축산 등의 유역현황 자료를 구축하였다. 이를 기반으로 국립환경과학원의 전국오염원조사자료 및 수질오염총량관리기술지침을 이용하여 원단위를 통한 지점별 비점부하량을 계산하였다. 마지막으로 지점별 유역특성과 모니터링 및 원단위에 의해 계산한 오염부하량을 교차분석하여, 유역특성에 따른 원단위의 적용성을 분석하였다. 본 연구에서 제시한 방법 및 결과는 원단위 적용을 위한 개선 방안 마련에 활용될 수 있을 것으로 기대된다.