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콩 유묘 부패를 일으키는 종자전염성 세균의 동시 검출을 위한 duplex PCR법 개발
Development of Duplex PCR detection for causal bacteria of seedling rot from soybean seeds
강미형 ( Mi Hyung Kang ) , 노태환 ( Tae Whan Noh ) , 심형권 ( Hyeong Kwon Shim ) , 최만영 ( Man Young Choi ) , 이휘종 ( Hwi Jong Lee ) , 김형무 ( Hyung Moo Kim )
UCI I410-ECN-0102-2015-500-002125488

콩 종자로부터 유래하여 유묘에 부패를 일으키는 콩불마름병(X. axonopodis pv. glycines, Xag)과 콩나물 무름병(Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, Pcc)을 동시에 진단하는 PCR 방법을 개발하였다. 콩불마름병 진단을 위하여 X. axonopodis pv. glycines의 특이적인 유전자로 알려져 있는 glycinecin A로부터 증폭 크기가 401bp인 Xag F1와 Xag R1 프라이머를 고안하였으며, 콩나물 무름병균의 특이적인 진단을 위하여 Carotovoricine 유전자에서 227bp 크기로 증폭이 가능한 Pcc F와 Pcc R 프라이머를 고안하였다. 두 쌍의 프라이머들은 두 세균만을 증폭하고 다른 오염균들은 증폭하지 않았으며, 이들 프라이머는 Xag를 2pg까지, Pcc는 20pg까지 증폭이 가능하였다. 이들 프라이머를 이용한 검출 방법은 콩 및 유묘 부패의 원인균인 감염종자를 검정할 수 있는 방법으로 활용 가능할 것이다.

Duplex PCR primers were developed for simultaneous detection of the important soybean seed pathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. glycines (Xag) and Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc) which cause highly loss of yield and decreased quality of seeds in order to eliminate infected soybean seeds with these pathogen. Two specific primer pairs, Xag F1/R1 and Pcc F/R, were designed from the sequences of glycinecin A gene of Xag and carotovoricin gene of Pcc for certain identification of Xag and Pcc, respectively, in order to distinguish contaminated seeds with pathogens. A duplex PCR method for simultaneous identification and detection of Xag and Pcc was developed by amplifying both 401bp and 227bp bands. Identification of Xag and Pcc were done in the sensitivity of 2pg and 20pg, respectively. This approach can be used to exclude infected soybean seeds which act as soft rot inoculum of soybean seedling.

[자료제공 : 네이버학술정보]
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