오이 모자이크 바이러스 (CMV)의 신속한 검정 및 동정을 위해 CMV-As 계통 RNA4의 염기서열을 토대로 외피단백질 유전자 부위에 대응하는 중합효소연쇄반응 (PCR) primer를 제작하였다. 역전사 중합효소연쇄반응 (RT-PCR)은 바이러스의 외피단백질 유전자에 특이적인 18개 염기로 구성된 primer를 사용하여 순화바이러스 RNA와 감염식물 핵산추출액을 주형으로 하였을때 671 bp의 DNA 절편이 증폭되었다. 이 방법을 사용하여 검정가능한 바이러스의 최소농도를 조사한 결과 순화바이러스 RNA는 1.0 fg, 그리고 감염담배 조즙액의 경우 1 : 65,536 (w/v) 희석농도에서도 바이러스 검정을 할 수 있었다. 감자 바이러스 Y에 감염된 담배 및 건전담배의 조즙액과 CMV 특이적 primer를 사용한 결과에서는 PCR 증폭산물이 관찰되지 않았다. 이 RT-PCR은 CMV-As와 CMV-Y 계통 모두에서 검정이 가능하였다. 제한효소 분석을 사용하여 CMV-As 및 Y 계통에서 증폭된 PCR 산물을 비교한 결과 서로 구별되는 다형성을 보였다. 즉, CMV-As 계통을 주형으로 생성된 PCR 산물은 EcRI과 EcoRV 제한효소 절단부위가 각각 1개씩 존재하였으며, CMV-Y로부터 증폭된 PCR 산물 DNA는 단지 1곳의 HindIII 부위만을 포함하였다. 한편 이 RT-PCR 방법을 포장에서 채집한 고추, 토마토 및 배추에 적용한 결과 이들로부터 CMV 감염개체를 검정할 수 있었다.

Based upon the nucleotide sequence of As strain of cucumber mosaic virus (CMV-As) RNA4, coat protein (CP) gene was selected for the design of oligonucleotide primers of polymerase chain reaction (PCR) for detection and identification of the virus. Reverse transcription and polymerase chain reaction (RT-PCR) was performed with a set of 18-mer CMV CP-specific primers to amplify a 671 bp fragment from crude nucleic acid extracts of virus-infected leaf tissues as well as purified viral RNAs. The minimum concentrations of template viral RNA and crude nucleic acids from infected tobacco tissue required to detect the virus were 1.0 fg and 1 : 65,536 (w/v), respectively. no PCR product was obtained when potato virus Y-VN RNA or extracts of healthy plants were used as templates in RT-PCR using the same primers. The RT-PCR detected CMV-Y strain as well as CMV-As strain. Restriction analysis of the two individual PCR amplified DNA fragments from CMV-As and CMV-Y strains showed distinct polymorphic patterns. PCR product from CMV-As has a single recognition site for EcoRI and EcoRV, respectively, and the product from CMV-Y has no site for EcoRI or EcoRV but only one site for HindIII. The RT-PCR was able to detect the virus in the tissues of infected pepper, tomato and Chinese cabbage plants.