선천성 기형의 예방은 지난 몇십년동안 타질환의 그것만큼 발전하지는 못하였다. 즉, 출생전 검사로 이상을 가진 태아의 임신중절등 적은 예에서만 예방에 성공하였다. 예방의 이상적인 방법은 1차적인 직접적 원인들을 확인하여 제거하는 것이자만 그것들을 모를 경우에는 중간단계를 차단하기 쉬운 2차적인 보조원들을 찾아야 한다. 선천성 기형 예방방법의 새로운 모색은 유전상담의 확대, 출생전 검사방법의 개선 및 선천성 기형아의 선택적 자연유산 과정(Terathanesia)에 관한 연구에서 찾아야 할 것이다.
